उन्हें आदर के साथ लोग सत्येन बोस के नाम से भी पुकारते थे। अलीपुर बम मामले में विचाराधीन कैदी के रूप में अलीपुर जेल अस्पताल में रखे जाने के दौरान सत्येंद्रनाथ बोस ने साथी कैदी कनाईलाल दत्त की मदद से राजकीय गवाह नरेंद्रनाथ गोस्वामी की गोली मार कर हत्या कर दी थी। बोस ने जेल परिसर में आत्मसमर्पण कर दिया और बाद में उन पर मुकदमा चलाया गया था।
सत्येंद्रनाथ बोस का जन्म पश्चिम बंगाल के मिदनापुर जिले में हुआ था।
वे श्रीअरविंद के मामा थे, हालांकि उम्र में वे लगभग दस वर्ष उनसे छोटे थे। प्रवेश और एफए परीक्षा उत्तीर्ण करने के बाद, सत्येंद्रनाथ ने कलकत्ता विश्वविद्यालय के बीए मानक तक अध्ययन किया, लेकिन बीए परीक्षा के लिए नहीं गए। उन्होंने कालेज छोड़ दिया और मिदनापुर कलेक्टरेट में लगभग एक वर्ष तक सेवा की।
वे स्वतंत्रता संग्राम में उग्र विचारों वाले क्रांतिकारियों में शामिल हो गए थे। उनको मिदनापुर में अपने भाई के नाम पर लाइसेंसी बंदूक रखने के आरोप में पुलिस ने गिरफ्तार किया था। पुलिस रिपोर्ट के अनुसार, उन्हें दोषी ठहराया गया और दो महीने के कठोर कारावास की सजा सुनाई गई।
पुलिस ने 2 मई, 1908 को कोलकाता में मुरारी पुकुर रोड स्थित एक परिसर पर छापा मारा और हथियारों का जखीरा, बड़ी मात्रा में गोला-बारूद, बम, डेटोनेटर और अन्य उपकरणों के साथ एक बम-फैक्टरी की खोज की। क्रांतिकारी साहित्य भी जब्त किया। पूरे बंगाल और बिहार में विभिन्न स्थानों पर छापे मारे गए, और अरबिंदो घोष, बारींद्र कुमार घोष, उल्लासकर दत्त, इंदु भूषण राय और कई अन्य लोगों को गिरफ्तार किया गया।
इस दौरान एक बंदी नरेंद्रनाथ गोस्वामी (उर्फ नरेन गोसाई) अंग्रेजों का समर्थक बन गया और पुलिस को कई क्रांतिकारियों के नामों का खुलासा करना शुरू कर दिया, जिससे आगे की गिरफ्तारियां हुईं।
1908 में चंद्रनगर स्टेशन पर गवर्नर की ट्रेन पर बमबारी के प्रयास में कथित संलिप्तता के लिए बारीन घोष, शांति घोष और उल्लासकर दत्त के नामों का उल्लेख किया गया था। मेयर के घर में बम विस्फोट के आरोप में चारुचंद्र राय, जो चंद्रनगर के क्रांतिकारी संगठन के नेता थे, को गिरफ्तार किया गया।
बारीन घोष के नेतृत्व में विचाराधीन कैदियों ने अलीपुर सेंट्रल जेल से भागने और गोस्वामी से छुटकारा पाने की योजना बनाई। बैरिस्टर बीसी राय ने कैदियों का बचाव करते हुए हथियारों से मदद की पेशकश की। 23 अगस्त को, शुधांगशु जीनन राय ने तस्करी कर जेल में एक पिस्तौल पहुंचाई।
31 अगस्त, 1908 को, हाईन्स नामक एक यूरोपीय अपराधी ओवरसियर द्वारा नरेंद्रनाथ को उस वार्ड से जेल अस्पताल लाया गया था। नरेंद्रनाथ ने स्पष्ट रूप से उस समय, अस्पताल में, दो साथी कैदियों से मिलने की व्यवस्था की थी, जो पहले से ही जेल अस्पताल में मरीज थे, जिनका नाम कनाईलाल दत्त और सत्येंद्रनाथ बोस था। कनाईलाल और सत्येंद्रनाथ दो रिवाल्वर हासिल करने में कामयाब रहे। उन्होंने नरेन गोस्वामी की हत्या कर दी और दोनों को गिरफ्तार कर लिया गया।
नरेंद्रनाथ गोस्वामी की हत्या क्रांतिकारी आतंकवाद के इतिहास में पहला साहसिक कार्य था। 21 अक्तूबर 1908 को हाई कोर्ट ने अपना फैसला सुनाते हुए दोनों को मौत की सजा सुनाई। कनाईलाल ने ऐसे आदेश के खिलाफ अपील दायर करने से इनकार कर दिया। 10 नवंबर 1908 को सुबह लगभग सात बजे अलीपुर जेल में कनाईलाल को फांसी दे दी गई। सत्येंद्रनाथ के मुकदमे में सत्र न्यायाधीश ने जूरी के बहुमत के फैसले से असहमत होकर मामले को उच्च न्यायालय में भेज दिया और वहां उन्हें दोषी ठहराया और मौत की सजा सुनाई गई। 21 नवंबर, 1908 को उन्हें फांसी दे दी गई।