90 के दशक में नाना पाटेकर और मनीषा कोइराला की लव स्टोरी ‘खामोशी’ से चल रही थी। लेकिन धीरे धीरे मनीषा और नाना के अफेयर की खबर बॉलीवुड गलियारे में होने लगी। 1996 में नाना पाटेकर और मनीषा कोइराला एक दूसरे के बेहद करीब आ गए थे। उस वक्त दोनों फिल्म ‘अग्नि साक्षी’ की शूटिंग साथ कर रहे थे। उस रोज मनीषा कोइराला का ताजा ताजा ब्रेकअप हुआ था। एक्टर विवेक मुशरन से मनीषा कोइराला का रिश्ता टूट गया था। ऐसे में मनीषा का ध्यान नाना पाटेकर पर गया। वहीं नाना को भी मनीषा कोइराला का साथ अच्छा लगने लगा। ऐसे में दोनों ने एक दूसरे को डेट करना शुरू किया।

फिल्म अग्नि साक्षी की रिलीज के बाद संजय लीला भंसाली की फिल्म ‘खामोशी’ में दोनों सितारों ने काम किया। ये फिल्म इसी साल रिलीज हुई थी जिसे दर्शकों ने खूब पसंद किया। इस बीच दोनों की प्रेम कहानी की दास्तां जंगल में आग की तरह फैल गई। बॉलीवुड शादी के मुताबिक नाना पाटेकर को पड़ोसियों द्वारा कई बार मनीषा कोइराला को उनके घर ड्रॉप करते देखा। वहीं कई बार नाना पाटेकर सुबह सुबह मनीषा के घर से बाहर जाते भी देखे जाते रहे। ऐसे में एक बार नाना ने इस बात का जवाब थोड़ा उखड़े अंदाज में देते हुए कहा था- वह कई बार मेरे घर आती हैं मेरी मां और बेटे को देखने के लिए।’

नाना पाटेकर की एक गलती के चलते मनीषा कोइराला उनकी जिंदगी से हमेशा हमेशा के लिए चली गई थीं। फिल्मफेयर को दिए इंटरव्यू में नाना ने इस बारे में खुलासा कर बताया था कि मनीषा के जाने के बाद वह उन्हें बहुत याद करते हैं। नाना ने कहा था- ‘मनीषा कोइराला इंडस्ट्री की सबसे सेंसेटिव अदाकाराओं में से एक हैं। वह कस्तूरी हिरन की तरह हैं। उन्हें अभी भी यह समझने की जरूरत है कि उन्हें किसी के साथ तालमेल बिठाने की जरूरत नहीं है। उनके पास सब है और किसी चीज की जरूरत नहीं है।’

नाना ने आगे कहा था- ‘मैं उन्हें ऐसे देख कर अपनी आंखों से आंसू रोक नहीं पाता हूं कि वह क्या कर रही हैं अपने साथ। शायद मेरे पास कुछ कहने के लिए नहीं है आज। ब्रेकअप मेरे लिए बहुत ही मुश्किल दौर रहा। पीड़ा को जानने के लिए आपको इस दर्द से गुजरना पड़ता है। मैं उस दर्द को बयां नहीं कर सकता कि मैंने कैसे सहा। प्लीज उस बारे में बात न करें, मैं मनीषा को बहुत ज्यादा याद करता हूं।’

बताते चलें, शादीशुदा नाना अपनी बीवी को तलाक नहीं देना चाहते थे, जबकि मनीषा को दूसरी पत्नी बनना कबूल नहीं था। इसके बाद इनका रिश्ता टूट गया। इसके बाद नाना एक्ट्रेस आयशा जुलका के साथ लिवइन रिलेशन में रहने लगे थे।